安捷伦 TapeStation 仪器助力中国农科院生物所/北京农学院中华水韭基因组学研究

此研究结合二代、三代基因组测序和 Hi-C 数据，组装了包含 22 条染色体 2.13 Gb 的中华水韭四倍体基因组，其 scaffold N50 达到 86.66 Mb。

在二代测序流程中，样品文库制备是关键步骤，不仅耗时费力且成本较高。对制备过程中间步骤的起始样品，以及对测序之前的最终文库进行质量控制，可识别质量较差或浓度不足的样品，确保获得成功的序列数据，有助于节省时间和资源。样品质量信息还可帮助排除故障或优化文库制备方案。

安捷伦 TapeStation 系统是用于 DNA 和 RNA 样品质量控制的自动化电泳解决方案。该系统集成了仪器、数据处理软件、试剂和专门用于 DNA 和 RNA 的 ScreenTape 胶条。其适用于分析样品的分子量、数量和完整性，可实现从低到高的各种样品通量，并提供高精度分析评估。本文中作者在提取RNA之后使用安捷伦 4150 TapeStation 系统进行了RNA浓度、纯度和完整性以及NGS文库质量的分析，确保最终的实验结果真实可靠。

安捷伦自动化电泳产品系列提供了多种用于核酸 QC 分析的仪器，包括生物分析仪系统、片段分析仪系统、TapeStation 系统和 Femto Pulse 系统。自动化电泳仪非常适合在整个 NGS 文库制备过程中测定样品的分子量大小、浓度和摩尔浓度，已在科学文献中广为引用。

中国农业科学院生物技术研究所梁哲研究员为论文通讯作者，北京农学院崔金腾和生物所客座研究生/格致博雅生物科技朱云柯为论文第一作者。该研究得到了农科院创新工程和城乡生态环境北京实验室项目等资助。